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猪生殖与呼吸综合征病毒广东株ORF3和ORF5基因的克隆与分析
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陈建君1，2， 宋长绪1， 王贵平1， 杨增岐2
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(1. 广东省农业科学院 兽医研究所， 广东 广州510640; 2. 西北农林科技大学， 陕西 杨凌712100)
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摘要：
采用RTPCR方法扩增了猪生殖与呼吸综合征病毒广东株的糖蛋白基因ORF3、ORF5，并对其进行了克隆和序列分析。用Blast分析软件比较分析了其与VR2332株以及流行的欧洲株之间的同源性，并对其编码氨基酸序列的分子质量、等电点、穿膜区、糖基化位点进行了分析。结果显示，PRRSV广东株ORF3与美洲株的同源性达90%，而与欧洲株只是在318～393bp、502～697bp之间有77%左右的同源性；ORF5与美洲株的同源性为88%，与欧洲株仅在133～209bp区间有77%左右的同源性。 关键词：
猪生殖与呼吸综合征病毒； ORF3和ORF5； 克隆与分析
中图分类号：S 852.659.6 文献标识码：
A 文章编号：1000-6419(2003)12-0019-04 |
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Cloning and sequence analysis of the ORF3 and ORF5 gene of Guangdong strain of porcine reproductive and respiratory syndrome virus
CHEN Jianjun1，2, SONG
Changxu1, WANG Guiping1, YANG
Zengqi2
(1 .Veterinary Medicine Institute, Guangdong Academy of Agricultural Sciences, Guangzhou 510640,
China; 2. Northwest SciTech University of Agriculture and Forestry, Yangling 712100,China) |
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Abstract:porcine reproductive and respiratory syndrome virus(PRRSV) Guangdong strain ORF3 and ORF5 gene were amplified by RTPCR,cloned and sequenced.The sequences were compared with VR2332 and Europe strain in blast.Molecular analysis of the predicted product of ORF3 and ORF5,such as amino acids,molecular weight,isoelectric point,epitope and transmembrane region,were performed in Expasy,which contributed to efficiently express the encoding product of ORF3 and ORF5 in vitro and explore it’s function.
Key words: PRRSV; ORF3 and ORF5; cloning and analysis |
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